第三章   生物学


3.27 治疗艾滋病的潜力药物制剂的计算机结构:对抗艾滋病病毒-1 中gp120蛋白的V3环的糖脂类。

项目负责单位、联系人

1)国家科研机关《白俄罗斯科学院联合信息研究所》
地址:220012,明斯克市,苏尔加诺夫大街6号
电话:+375 (17) 284-21-75; e-mail: itekan@newman.bas-net.by; URL: http://uiip.bas-net.by/

技术科学博士——屠吉科夫 亚历山大 瓦西里耶维奇
电话:+375 (17) 284-21-40; e-mail: tuzikov@newman.bas-net.by

2) 国家科研机关《白俄罗斯科学院生物有机化学研究所》
地址:220141,明斯克市,库普列维奇大街5号,2号办公室
电话/传真:+375 (17) 267-87-61

技术科学博士——安德里阿诺夫 亚历山大 米哈伊尔洛维奇
电话:+375 (17) 264 82 63; e-mail: andrianov@iboch.bas-net.by

项目简介

该项目目 标是构建出可在原子水平上描述出白俄罗斯特有的亚门A的艾滋病病毒-1中V3环的复合体结构和动力学特征的数学模型,与文献数据相符合的水溶性类似物质中 含半乳酶-酰基桥鹌鹑,可以抑制病毒复制,封闭通过与V3环结合进入感觉细胞的这一过程。在计算数据的基础上实现糖脂类变体的计算机结构,与原始的脂类化 合物相比更有效地封锁病毒行列类的主要抗原,借助该基础结构在创建新一代更有效的抗病毒制剂方面成为了更有前景的药理学对象。

项目描述

这种现代 计算方法的结合是第一次被采用,这种方法可预见艾滋病病毒-1中V3环中的免疫复合体«короны»的结构功能和性能。带有糖脂类GalCer和它的水 溶性相似物的六肽Gly-Pro-Gly-Arg/Gln-Ala-Phe,并没有关于它的空间结构实验数据。从计算结果得出,艾滋病病毒-1中V3环中 的免疫复合体«короны»中的苯丙氨酸和精氨酸在与糖脂结合方面起到关键作用。含有所暗算的V3环的GalCer复合体形成物的自由能量的计算数值与 实验数据相符,这证明了所建模型和计算图表完全吻合。GalCer中所设计出的水溶性相似物的两个理论显示出结合有V3环的病毒中心部分的仿射性与原分子 是接近的,并且可以作为基础结构用于新的有效的抗病毒样品的合理设计中。
虽然所计算出的结果与给出的文献有一定相符度,为了得到结合有蛋白质 gp120的糖脂类的相互活动的更确切信息,提出了可以用完整无损的V3环进行计算。类似的研究应该可以得到GalCer变体更宽的数列,借助其后来的结 果进行试验和基础结构的取样,可成为制造新一代抗病毒制剂的有前途的药理研究对象。
除此之外,根据GalCer方式提出的V3环中心部分的复合体模型,还是更好理解艾滋病病毒-1功能原理的基础,同样也可以用于以后对病毒结构和功能关系的研究中。这对成功实现致力于研究更广泛治疗领域的抗病毒方法的蛋白质工程项目也是必不可少的。
 

技术类型

经济技术优势

1.   现今主要致力于研究抗病毒制剂的研制,主要集中在研究亚门B的艾滋病病毒-1中V3环的结构。这在北美、南美、西欧、日本、澳大利亚和泰国都占有找你更要 地位。曾经类似的对亚门A研究在东欧,包括白俄罗斯也占有重要地位,但到现在为止仍没有实现,因此对此很感兴趣;

2.   利用现代计算机三维结构模拟方法能够使结构数据的选取过程绝对的合理化,能消除信息不足的问题,可用在未来的工作中检测制造抗病毒制剂。

项目创新点

1.   所提出的规定鞘糖脂作为潜在内科药剂这一解决方法 是传统方法的变体,其中为了防止艾滋病病毒传播,将V3环的诱生物向水溶性类似物吸引,这在世界文献中还是没有的。

2.   包含现代计算法组合的方法是第一次被使用,为了发现GalCer的结构和它的水溶性类似物,以及带有V3环的复合体和形成的糖脂类。

推介该技术的领域

现阶段研究成果在研讨会上做过报告:
—于2008年10月1日-3日在明斯克举办的第二届国际研讨会《用于保健的现代信息和远距离医疗技术》,AITTH’2008;
—于2010年5月25-27日在明斯克举办的第三次国际研讨会《超级计算机系统和它的应用》SSA’2010;
—于2010年10月10-15日在普希诺举办的第三次国际研讨会《数学生物物理学和生物学》ICMBB’2010。
 

关键词

生物物理学,生物化学,医学,生物信息学 

项目目前所处阶段

知识产权资格

技术应用领域

制造治疗艾滋病药剂的蛋白质工程项目
   致力于艾滋病病毒-1的功能原理的基础研究。
  

IRC欧洲创新驿站分类信息

技术适用地区

实践经验

GalCer的水溶性相似物的两种计算在白俄罗斯国家科学院生物有机化学研究所被综合起来,并且反对用于在РНПЦ流行病学和微生物学共和党科学实践中心中抗病毒活性。在研究过程中出现了抗击艾滋病病毒的综合性物质。

对周围环境的影响

合作形式

转让技术的限制和条件

转让技术时提供的支持